研發投資抵減的申請，比營所稅結算申報期間早3個月開始受理。窗口一關，主管機關就不受理。
經濟部產業發展署的說明是：曆年制公司在2月至5月之間申請，逾期申請不予受理，申請書的附件1至3要提供紙本及電子檔（申請注意事項、辦法說明）。智慧機械等投資抵減更早，結算申報期間開始前4個月就開放線上登錄。
產業創新條例的三種投資抵減，截至2026年10月的條文如下（第10條、第10條之1、第10條之2、第72條）：
| 條文 | 抵減對象 | 抵減率 | 上限 | 施行期間 |
|---|---|---|---|---|
| 第10條 | 研究發展支出 | 當年度15%，或三年內10% | 各年度應納營所稅30% | 2017.11.24–2029.12.31 |
| 第10條之1 | 智慧機械、5G、資安、AI、節能減碳的全新投資 | 交貨當年度5%，或三年內3% | 30%，併用合計50% | 2025.1.1–2029.12.31 |
| 第10條之2 | 前瞻創新研發／先進製程全新設備 | 25%／5%，限當年度 | 各30%，合計50% | 2023.1.1–2029.12.31 |
30%上限的分母
「當年度應納營所稅」包括哪些？研發投抵辦法把它定為稽徵機關核定的當年度應納稅額，再加上核定的上一年度未分配盈餘加徵稅額（研發投抵辦法第12條）。抵減方式在結算申報時擇定，申報期間屆滿後不得變更（第11條）。
算一次就清楚。某子公司研發支出6,000萬元，當年度應納營所稅1,000萬元（虛構情境）。選15%，可抵900萬元，但上限是300萬元。選10%，600萬元分三年抵；如果次年稅額相近、也沒有其他抵減，第一年、第二年各抵300萬元。研發支出遠大於稅額時，三年分抵可能抵得較多。
同一年併用時另有總額限制。智慧機械等投資抵減與其他投資抵減合併適用，當年度合計不超過應納營所稅50%（第10條之1第2項）。研發投抵已用滿30%，智慧機械等投抵最多只能再抵20%。
送件分兩段
第一段是向主管機關申請。研發投抵要附組織系統圖與研究人員名冊、研究用消耗性器材的完整進領料紀錄、研究計畫或報告等文件（研發投抵辦法第14條）。專用技術、資料庫與軟體、委託國外大專校院或研究機構、共同研發的支出要申請專案認定，與審查意見併案提出（第9條、第14條第3項）。與國外母公司共同研發，還要說明國內沒有適當的共同研發對象（第8條）。前瞻創新研發抵減同樣是申報期間開始前3個月起至截止日內送件，逾期不受理（前瞻研發抵減辦法第13條）。
智慧機械等投抵全程線上：交貨當年度結算申報期間開始前4個月起至截止日內，登錄經濟部申辦系統上傳投資計畫，逾期不得登錄，也不能改用紙本（智慧機械投抵辦法第12條、第14條）。同一課稅年度只能申請一次（第13條）。
第二段是結算申報。三種抵減都要在申報時依規定格式填報。智慧機械等投抵與前瞻創新研發抵減，申報期間屆滿前沒有填報就不得適用（智慧機械投抵辦法第16條、前瞻研發抵減辦法第17條）。研發投抵填報資料有疏漏，可在申報期限屆滿前補正，逾期未補正，稽徵機關得不予受理（研發投抵辦法第15條）。研發投抵的審查意見，由主管機關在申報截止日後7個月內送到國稅局（第14條第2項）。
申報期限延後時，窗口也跟著延。113年度結算申報截止日展延至2025年6月30日，產業發展署公告前瞻創新研發抵減的申請期限比照展延（產業發展署申辦頁面）。
前瞻創新研發抵減的門檻
門檻很高。112年度是實施首年，經濟部表示共有4家企業申請（賦稅署2024年6月18日新聞稿）。
第10條之2要求在國內進行技術創新、居國際供應鏈關鍵地位，研究發展費用達60億元，研發費用占營業收入淨額6%（以會計師查核簽證的個體綜合損益表為準），有效稅率112年度不低於12%、114年度起不低於15%，且最近三年內沒有重大違反環保、勞工或食安法規（前瞻研發抵減辦法第3條）。先進製程設備要當年度購置達100億元。核准適用25%者，當年度全部研發支出不得再用第10條；核准適用5%者，當年度全部機器設備支出不得再用第10條之1（條例第10條之2第3項）。申請時沒有聲明同意變更適用的，事後不能改用（第19條）。
未分配盈餘、最低稅負與分公司
用盈餘做實質投資，可以減少所得稅法第66條之9的5%未分配盈餘加徵。當年度盈餘在次年起三年內用於自用的建築物、軟硬體設備或技術，合計達100萬元，投資金額可以從未分配盈餘中減除（第23條之3、實質投資辦法第3條）。申報後才完成投資的，在完成投資之日起一年內申請重行計算退稅。從申報期間屆滿的次日起（申請更正退稅的，從申請的次日起）三年內轉借、出租、轉售或變更用途，要補繳並加計利息（實質投資辦法第6條）。未分配盈餘的申報時程，見營所稅行事曆。
抵減用得多，要回頭算最低稅負。一般所得稅額低於基本稅額時，差額另行繳納，且不得以投資抵減稅額減除（所得基本稅額條例第4條）。115年度的基本稅額，是基本所得額扣除60萬元後按行政院訂定的稅率計算，法定範圍12%至15%（第8條）；中區國稅局2026年5月8日說明現行徵收率為12%（新聞稿）。
外資持股不影響資格。研發投抵辦法以「依公司法設立之公司」為資格條件，條文沒有股東國籍的限制（第3條；智慧機械投抵辦法第7條亦同）。外國公司依外國法律組織登記，須辦分公司登記才能在台營業（公司法第4條、第371條）；分公司能否適用，申請前宜先向所在地國稅局及主管機關確認。員工獎酬股票緩課是同一條例第19條之1的另一項優惠，見這篇。
想確認研發委託架構或設點形式是否符合資格條件，可以寫信到昊鼎國際法律事務所（wei@hoveringlaw.com.tw），附上決算月份、各年度研發支出，以及設備的訂購日與交貨日。
參考的官方資料
- 產業創新條例（2025年5月7日修正）第10條、第10條之1、第10條之2、第23條之3、第72條
- 公司或有限合夥事業研究發展支出適用投資抵減辦法（2023年11月16日修正）第3條、第8條、第9條、第11條、第12條、第14條、第15條
- 公司或有限合夥事業投資智慧機械與第五代行動通訊系統與資通安全人工智慧產品或服務及節能減碳抵減辦法（2025年11月27日修正發布全文）第7條、第12條、第13條、第14條、第16條
- 公司前瞻創新研究發展及先進製程設備支出適用投資抵減辦法（2023年8月7日發布）第3條、第13條、第17條、第19條
- 公司或有限合夥事業實質投資適用未分配盈餘減除及申請退稅辦法（2020年1月9日發布）第3條、第6條
- 所得稅法 第66條之9
- 所得基本稅額條例（2021年1月27日修正）第4條、第8條
- 公司法（2025年12月26日修正）第4條、第371條
- 經濟部產業發展署：研發投抵申請注意事項（2026年2月26日更新）、研發投抵辦法說明、前瞻創新研發及先進製程設備投資抵減申辦頁面（2025年11月7日更新）
- 財政部賦稅署：前瞻創新研發投抵首年申請情形新聞稿（2024年6月18日）
- 財政部中區國稅局：115年度營利事業最低稅負新聞稿（2026年5月8日）
確認日期：2026年10月6日
常見問題
- 曆年制公司的研發投資抵減，什麼時候要送件？
- 研發投抵要在營所稅結算申報期間開始前3個月起至申報期間截止日內，向中央目的事業主管機關申請審查意見；產業發展署說明曆年制公司是2月至5月，逾期不受理。之後在5月結算申報時依規定格式填報，並檢附文件。
- 研發投抵和智慧機械投抵可以同一年一起用嗎？
- 可以，但各自不超過當年度應納營所稅30%，同一年度合併適用其他投資抵減時，合計不超過50%（產業創新條例第10條之1第2項）。研發投抵用滿30%後，智慧機械等投資抵減最多再抵20%。
- 外國公司在台分公司也能適用嗎？
- 研發投抵與智慧機械投抵的辦法都以「依公司法設立之公司」或有限合夥事業為資格條件，條文沒有以股東國籍設限，外資持股的在台子公司符合形式要件。分公司是否適用，目前沒有找到現行的官方解釋，建議申請前先向所在地國稅局及主管機關確認。
本文僅供一般資訊參考，並非針對個別案件的法律意見。
